Nel frattempo ho risolto; spiego come.
All'inizio ho commesso l'errore di posizionare male l'accessorio di livellamento e al primo tentativo la stampante ha memorizzato una posizione errata.
Pensando di risolvere con l'apposita funzione di cancellazione della memoria del livellamento, ho provato questa via senza successo; la posizione rimane memorizzata. Probabilmente vi è un bug che non permette il reset del livellamento.
Ho preso quindi la SD card che è nella confezione e dentro ho trovato il firmware che ho ricaricato da zero; questa operazione ha azzerato la flash della main board e quando ho riprovato a livellare, tutto è andato per il verso giusto.
Spero che possa essere d'aiuto a quelli che hanno avuto lo stesso problema.