Il bowden ti serve solo per il tratto dall'estrusore all'hotend, per andare dalla scatola all'estrusore puoi usare qualsiasi cosa, tipo un tubo in silicone anche dal doppio di diametro (tipo roba da acquari) oppure un vecchio bowden di quelli bianchi lofi... Non capisco che problema ti poni per l'estrusore, la fatica che fa e' nell'hotend a meno che tu non abbia ora un estrusore di quelli lofi che manco riesce a spingere il filo, in quel caso compra un dual gear a prescindere.
2. Si' allora compra un direct magari. Se il problema e' solo il TPU io prima proverei con quello che ho, magari se fai roba bassa / piccola taglia un pezzo di bowden il piu' corto possibile... Ma se hai un 50-100e da spendere da TriangleLab ci sono un paio di direct gia' pronti per ender 3, vedi te quando spendere.