potresti fare una cosa:
Lo stesso oggetto fai lo slice con il petg e poi con l'abs entrambi su file, poi prendi il primo e all'altezza del layer che ti interessa lo tronchi,, poi prendi il secondo e incolli dallo stesso punto in giù la parte di ti interessa... ed in mezzo metti il comando/procedura per cambiare filo...
dovrebbe funzionare e usare i parametrei adatti per ogni materiale.