certo che può modificare i dati della eeprom, per impostare gli step per ogni motore lo può fare benissimo, io lo faccio e l'ho fatto quando ho cambiato estrusore, ed io ho una Ender 3. quindi può anche dare un bel reset alla eeprom
comunque per fare una prova stacca il cavo da Z e collegalo ad E, poi nel pannello, quando vai in move axis fai muovere Z di 50mm e vedi se ti estrude effettivamente 50mm.
poi collega il cavo di E a Z e fai alzare Z di 50mm, muovendo l'asse E, e misura se si alza di quella quota